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  • 2020年西藏一江两河区、藏东南、川西藏东横断山区农田土壤微生物数据库
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    中文标题 2020年西藏一江两河区、藏东南、川西藏东横断山区农田土壤微生物数据库
    英文标题 Farmland soil microbial database of Yarlung Zangbo River and Its Two Tributaries in Tibet, Southeast Tibet, west Sichuan and East Tibet hengduan Mountain in 2020
    中文摘要 该数据集包含了西藏一江两河、藏东南、川西藏东横断山区农田土壤真菌和细菌样品测序编号和说明，可用于分析西藏一江两河、藏东南、川西藏东横断山区农田生态系统真菌和细菌群落组成和多样性的空间分布特征，以及解析外生菌根真菌、病原真菌和腐生真菌群落在农田中的空间分布。我们在Excel表格中提供了2020年西藏一江两河、藏东南、川西藏东横断山区农田样带土壤采样点信息，每个采样点分别测了三个真菌和细菌样品的技术重复，编号为-1，-2，和-3，对应三个高通量测序下机fastq原始文件。Fastq文件是用NovaSeq 6000进行两端测序（250✖250）的测序下机数据，使用前需要进行序列质控、去除嵌合体、聚类、数据库比对和注释等，获得OTU表格以后再进行后续统计分析。
    英文摘要 The dataset contains the sequencing numbers and descriptions of soil fungal and bacterial samples from farmland in the Yarlung Zangbo River and Its Two Tributaries in Tibet, Southeast Tibet, west Sichuan and East Tibet hengduan Mountain, which can be used to analyze the spatial distribution characteristics of fungal and bacterial community composition and diversity in the farmland ecosystems of the these area, as well as to analyze the spatial distribution of exophytic mycorrhizal fungi, pathogenic fungi and saprophytic fungal communities in farmland. We provided the information of soil sampling points in the farmland sample belt of Yarlung Zangbo River and Its Two Tributaries in Tibet, Southeast Tibet, west Sichuan and East Tibet hengduan Mountain in 2020 in an Excel table, and each sample point measured three technical replicates of fungal and bacterial samples, numbered -1, -2, and -3, corresponding to three high-throughput sequencing machine fastq original files. Fastq file is the use of NovaSeq 6000 for both ends of sequencing (250✖250) of the sequencing machine data, before use need to carry out sequence quality control, removal of chimeras, clustering, database comparison and annotation, etc., after obtaining the out table and then follow-up statistical analysis.
    数据文件命名方式和使用方法 我们提供的Excel表格名称和表格中每个样品的fastq所放置的文件名称是一致的，比如均为西藏一江两河、藏东南、川西藏东横断山区农田微生物数据库2020。另外，表格中每个采样点信息跟放置fastq文件夹中的每个fastq的文件名称一致。Fastq文件是用NovaSeq 6000进行两端测序（250✖250）的测序下机数据，使用前需要进行序列质控、去除嵌合体、聚类、数据库比对和注释等，获得out表格以后再进行后续统计分析。
    英文数据文件命名方式和使用方法 The name of the Excel table we provide is consistent with the file name placed in the fastq of each sample in the table, such as the Farmland Microbiology Database of arlung Zangbo River and Its Two Tributaries in Tibet, Southeast Tibet, west Sichuan and East Tibet hengduan Mountain. In addition, the information for each sample point in the table matches the name of the file for each fastq placed in the fastq folder. Fastq file is the use of NovaSeq 6000 for both ends of sequencing (250✖250) of the sequencing machine data, before use need to carry out sequence quality control, removal of chimeras, clustering, database comparison and annotation, etc., after obtaining the out table and then follow-up statistical analysis.
    文件大小(MB) 21.5G
    时间范围 2020.7
    共享政策 C.离线共享：必须由数据提供者回复邮件决定是否共享，作者三天内不回复邮件则给用户发送邮件直接与数据作者联系。
    数据集序列
    数据使用许可 D.署名-非商业性使用 4.0 国际(CC BY-NC 4.0)
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    DOI类别 A.拥有自主知识产权
    DOI
    保护期时长 2年
    保护期说明
    空间范围:西 98.0
    空间范围:东 87.0
    空间范围:南 28.0
    空间范围:北 30.0
    比例尺
    时间分辨率 年
    空间分辨率 1km-10km
    投影