
中国科学院成都生物研究所
创建者:伍小刚
2020年西藏一江两河区、藏东南、川西藏东横断山区农田土壤微生物数据库
协议公开 完全公开
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专题名称:农田生态系统与粮食安全
创建时间:2022-06-06
时间范围:未知
地理范围:未知
数据集编号 2019QZKK0303-05-002
CSTR CSTR:31325.11.2019QZKK0303-05-12
数据集简介
该数据集包含了西藏一江两河、藏东南、川西藏东横断山区农田土壤真菌和细菌样品测序编号和说明,可用于分析西藏一江两河、藏东南、川西藏东横断山区农田生态系统真菌和细菌群落组成和多样性的空间分布特征,以及解析外生菌根真菌、病原真菌和腐生真菌群落在农田中的空间分布。我们在Excel表格中提供了2020年西藏一江两河、藏东南、川西藏东横断山区农田样带土壤采样点信息,每个采样点分别测了三个真菌和细菌样品的技术重复,编号为-1,-2,和-3,对应三个高通量测序下机fastq原始文件。Fastq文件是用NovaSeq 6000进行两端测序(250✖250)的测序下机数据,使用前需要进行序列质控、去除嵌合体、聚类、数据库比对和注释等,获得out表格以后再进行后续统计分析。
数据文件